Use este identificador para citar ou linkar para este item: http://bdta.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/3561
Título: Análise de bioinformática do gênero varibaculum análise genômica, filogenética e de genes de resistência, patogenicidade e ocorrência concomitante a carcinogênese 
Orientador(es): AZEVEDO, Juliana Simão Nina de
Autor(es): GUIMARÃES, Kelton Henrique Alves
Palavras-chave: Bioinformática - Varibaculum spp
Filogenética
Varibaculum spp - resistência
Data do documento: 2024-04
Editor: UFRA/Capanema
Citação: GUIMARÃES, Kelton Henrique Alves. Análise de bioinformática do gênero varibaculum análise genômica, filogenética e de genes de resistência, patogenicidade e ocorrência concomitante a carcinogênese. Orientadora: Juliana Simão Nina de Azevedo. 2024. 61 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Ciências Biológicas Bacharelado) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Campus Capanema, 2024. Disponível em: http://bdta.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/3561. Acesso em:
Resumo: Atualmente, é crescente a relevância de se ter o conhecimento para uma melhor compreensão do microbioma humano e da sua interação com o hospedeiro e de como os mecanismos de ação podem impactar direta e indiretamente no equilíbrio da saúde humana. Existem evidências suficientes de que uma microbiota desequilibrada está associada a um ambiente inflamatório escalante, além disso, esta condição leva a uma desregulação do sistema imunológico desencadeando sérias disfunções, tais como, processos carcinogênicos em diferentes áreas do corpo. Recentemente infecções causadas por bactérias do gênero Varibaculum . têm sido associadas com malignidades, sendo motivo de atenção por profissionais de saúde e pesquisadores devido sua abundante presença e crescimento em pacientes que apresentam algum tipo de malignidade, especialmente no trato urogenital. Assim, essa pesquisa foi realizada para aplicar processamentos aos genomas das espécies do gênero Varibaculum., utilizando ferramentas de bioinformática para análise dos elementos genômicos e cladograma do gênero, além de análise na literatura da relação do gênero com malignidades. Foram encontrados diferentes genes de resistência a antibióticos, também foram encontrados putativos fatores de virulência e defesa, regiões codificantes associados a aquisição de ferro e metabolismo de fósforo, nitrogênio, enxofre e potássio, ilhas de patogenicidade, proteínas oriundas de fago e elementos transponíveis, quimiotaxia e motilidade, diversas proteínas envolvidas com reparo do DNA. Foi feita a análise quantitativa de Open Reading Frame (ORF) e Coding Dna Sequence (CDS). Mapas circulares que mostraram a posição das ORF’s e CDS’s, assim como a localização de regiões de transferência horizontal de genes. Os parâmetros analisados permitiram construir um conhecimento em relação ao elementos que compõe o genoma de Varibaculum spp, como a quantidade elementos móveis, regiões putativas de eventos de transferencia horizontal de genes e produtos gênicos. As bactérias estão relacionadas com lesões malignas e inflamações do trato urogenital, e a análise do genoma permitiu mostrar os elementos relacionados com a virulência.
Abstract: Currently, it is imperative to understand the human microbiome and its interaction with the host and how the mechanisms of action can directly and indirectly impact on the balance of human health. There is sufficient evidence that an unbalanced microbiota is associated with an escalating inflammatory environment, in addition, this condition leads to a dysregulation of the immune system triggering serious dysfunctions, such as carcinogenic processes in different areas of the body. Recently, infections caused by bacteria of the genus Varibaculum have been associated with malignancies, and are a cause for attention by health professionals and researchers due to their abundant presence and growth in patients with some type of malignancy, especially in the urogenital tract. Therefore, this research was carried out to apply treatments and processing to the genomes of the species of the genus Varibaculum using bioinformatics tools to analyze the genomic elements and phylogeny of the genus. Different antibiotic resistance genes were found, as well as putative virulence and defense factors, coding regions associated with iron acquisition and phosphorus, nitrogen, sulfur and potassium metabolism, pathogenicity islands, phage-derived proteins and transposable elements, chemotaxis and motility, various proteins involved in DNA repair. Quantitative analysis of the Open ReadingFrame (ORF) and Coding Dna Sequence (CDS) was carried out. Circular maps showed the positionof ORFs and CDSs, as well as the location of horizontal gene transfer regions. The construction ofthe cladogram made it possible to identify monophyletic, paraphyletic and polyphyletic groups among the species analyzed. The parameters analyzed allowed us to build a knowledge regarding the elements that make up the genome of Varibaculum spp, such as the amount of mobile elements, putative regions of horizontal gene transfer events and gene products. The bacteria are related to malignant lesions and inflammations of the urogenital tract, and genome analysis allowed us to show the elements related to virulence.
URI: http://bdta.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/3561
Aparece nas coleções:TCC - Capanema - Bacharelado em Ciências Biológicas



Este item está licenciada sob uma Licença Creative Commons Creative Commons