A Biblioteca Digital de Trabalhos Acadêmicos (BDTA) é uma base digital de armazenamento e disseminação das obras intelectuais da Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA), produzidas no âmbito das atividades de graduação e especialização da instituição.
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http://bdta.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/2480| Title: | Estudo da variabilidade populacional do Pargo Lutjanus purpureus Poey, 1875 da costa norte do Brasil |
| Advisor: | SOUZA, Rosália Furtado Cutrim |
| Authors: | RODRIGUES, Célio Soares |
| Keywords: | Pargo (Lutjanus purpureus [Poey, 1875]) - Variabilidade genética População panmítica Estudos genéticos - Família Lutjanidae Isóbatas - Linha pargueira Pargo - Diversidade haplotípica |
| Issue Date: | 2014 |
| Publisher: | UFRA/Campus Belém |
| Citation: | RODRIGUES, Célio Soares. Estudo da variabilidade populacional do Pargo Lutjanus purpureus Poey, 1875 da costa norte do Brasil. 2014. 44 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Pesca) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Campus Belém, PA, 2014. |
| Resumo: | O pargo é uma espécie demersal da família Lutjanidae, que ocorre em águas costeiras de mares tropicais e subtropicais, com a importância econômica para a pesca. O presente trabalho teve como objetivo principal avaliar a redução da variabilidade genética do pargo na costa Norte brasileira. As amostras foram coletadas por embarcações da frota artesanal do estado do Pará, com auxítio do apetrecho de pesca: linha pargueira, nas isóbatas de 40 a 60 m e 60 a 100 m. O protocolo para extração de DNA foi a partir do kit de extração comercial QIAamp DNA Blood Mini kit (QIAGEN) seguindo as orientações padrões do fabricante. A diversidade genética foi estimada através do índice de diversidade haplotípica e índice de diversidade nucleotídica. Teste: de neutralidade de Fu (Fs) e Tajima (D), foram realizados no programa ARLEQUIN, para verificar os desvios de neutralidade e inferir sobre a história demográfica das Populações. Para estimar a hipótese de panmixia ou estruturação do pargo entre as isóbatas, foi realizada a análise hierárquica da variância molecular (AMOVA). Um fragmento de 997 pb da região controle mitocondrial foi obtido para 59 indivíduos de L.purpureus. À composição média de nucleotídeos foi de 31,90% A, 28,67% T, 17,11% G 2 22,30% C. As amostras apresentaram alta variabilidade genética quanto à diversidade haplotípica (h) e nucleotídica (x), com variação de 0,098 a 1,0 e 0,20 a 0,25, respectivamente. Os testes de Fs e D geraram valores negativos e significantes, o que indica desvio da neutralidade. Os índices de Fst variaram de 0, entre as diferentes populações, a 0,038 dentro das populações. A análise de variância molecular revelou maior diversidade de haplótipos dentro de populações (96,16%) do que entre À populações (3,84%). O pargo apresentou alta diversidade genética haplótipica (h) e nucleotídica (pi), refletindo uma alta variabilidade genética em equilibrio com um único pool gênico e uma única população panmítica ao longo da costa Norte. |
| Abstract: | The snapper is a demersal species in the family Lutjanidae, which occurs in coastal waters of tropical and subtropical seas, with the economic importance for fishing. This Study aimed to evaluate the reduction of genetic variability of snapper on the north coast of Brazil. The samples were collected by vessels of handmade fleet of Pará, with the aid of fishing tackle: “linha pargueira”. The protocol for DNA extraction from commercial extraction packet QlAamp DNA Blood Mini kit (QIAGEN) according to the manufacturer's standards and guidelines. The genetic diversity was estimated through of diversity haplotype and nucleotide levels, The neutrality test of Fu (Fs) and Tajima (D), were performed in the software ARLEQUIN, in order to verify of neutrality deviations, moreover to conclude the demographic history of populations. To estimate the hypothesis of panmixia or structuring on snapper structure between isobaths, an hierarchical analysis of molecular variance (AMOVA). A fragment of 997 bp of the mitochondrial control region was obtained for 59 individuals of L. purpureus. The average composition of nucleotides was the 31.90% A, 28.67% T, 17.11% G and C 22.30%. The samples showed high genetic variability regarding the haplotype diversity (h) and nucleotide (x), with variation of 0.098 to 1.0 and 0.20 to 0.25, respectively. The tests of Fs and D generated negative and significant values, which indicates deviation from neutrality. Fst indices ranged from 0, between the different populations, to 0.038 within populations. The analysis of molecular variance revealed greater diversity of haplotypes within populations (96.16%) than among populations (3.84%). The snapper presented high genetic diversity and haplotype nucleotide, reflecting a high genetic variability for the species in the two isobath sampled. The specie has proven to be a single large stock which allows to understand it as panmitic population. |
| URI: | bdta.ufra.edu.br/jspui//handle/123456789/2480 |
| Appears in Collections: | Relatório de Estágio Supervisionado Obrigatório - ISARH - Engenharia de Pesca |
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